博士延期交学费吗？
这个具体要看学校，还有专业吧。 我是2017年毕业的，那时候我们学校对延期的政策还不是那么宽松，有延期的需求的同学需要提前跟导师沟通，然后向学院提出延期申请，学院审批通过后交给学校，学校会统一联系相关部门和导师给延期的同学办理延期手续（一般是两年）。
但是！每个学校的政策都不一样哦~ 比如我师兄是某985的本科（当然是毕业很多年的了），他读研的时候换了一个专业（虽然还是同一个学校同一个学院），然后读到了第三年想要延期，结果导师说学校政策不允许，无论多么优秀都不可能让他继续在读半年了（毕竟都研三了）……然而当时同实验室的师弟恰好是第二个学期申请的延期，就顺利通过了。
所以呀，政策这种东西是很灵活的，你要嘛认识学校领导可以打个招呼帮忙沟通（当然这种操作只能用于特别特殊的情况，且你跟领导关系铁到不行）；要嘛跟导师沟通好让导师去帮你跟院系领导打招呼搞定了它；要么就自己硬着头皮去跟院长主任之类的高层领导磨一磨。
总之就是一句话，事情都是人做出来的嘛～只要你会磨、肯磨，没有办不了的事哟～ 至于你说“读三年博士还没拿硕士学位证”这个问题就更简单了呀，直接跟导师说啊，让导师跟学院申请补发啊。其实这个东西说起来真的挺尴尬的哈，毕竟是你拖了三年没发下去，现在反而怪到学校老师头上啦～不过以我个人经验而言（我硕士期间也是延期的哟），绝大多数的老师还是很通情理的，不会故意刁难你。